Der Kanton Schaffhausen ist der nördlichest Kanton von der Schweiz und ist fast ganz von der Bundesrebublik Deutschland umgeben. Schaffhausen ist nebst dem Kanton Jura, der waldreichste Kanton.Auffallend ist die durchschnittliche Regenmenge in diesem Kanton, die mit 863 mm im Jahr ist für Mitteleuropa eher gering ist. Ebenfalls wichtig für den Kanton Schaffhausen, ist die Tatsache, dass dieser Kanton hinter dem Zürich das zweitgrösste Weinbaugebiet in der Deutschschweiz ist.

Südlich des Gebirgzugs Randen  liegt das Klettgau, ein fruchtbares, flaches Tal, wo vorwiegend Reb- und Ackerbau betrieben wird. Ebenfalls im Kanton Schaffhausen liegt der Rheinfall, der grösste Wasserfall Europas.